工業(yè)工藝對很多企業(yè)來講至關(guān)重要。這些生產(chǎn)工序通常每年消耗大量的能源，因此生物酶技術(shù)在生產(chǎn)工藝的改進方面有著巨大的潛力。
人口的增長、更加嚴厲的環(huán)保政策和對循環(huán)材料的要求的提高，無疑將導(dǎo)致多數(shù)工業(yè)污水處理過程中能源消耗的增加。涵蓋從食品加工到紡織品生產(chǎn)的制造業(yè)有多種方法和工藝可供選擇。
我們平時用到的工藝通常是各種環(huán)境問題的起因，這些工藝可能產(chǎn)生很多化學(xué)殘渣、難處理的廢物附加物和排放包含有機污染物和致病菌的有毒廢水。這些工藝也存在很多其他的瑕疵，比如說工藝效率低。在最近的工業(yè)發(fā)展過程中，很多企業(yè)已經(jīng)轉(zhuǎn)向使用微生物方法運作來杜絕常規(guī)方法可能導(dǎo)致的問題。
政府對工業(yè)垃圾和污水排放更嚴厲的標(biāo)準(zhǔn)和要求和，更強硬的環(huán)保規(guī)范以及成本效率也在這一轉(zhuǎn)變中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。將新的工藝加入到現(xiàn)有的處理設(shè)備上很困難同時成本較高。而微生物方法對工廠設(shè)計和設(shè)備的要求較低并且已被證實是行之有效的。